Todo el tema se hace más complejo si hay transparencias.
Por esa razón se recomienda* no imprimir especialmente en esos casos, directamente desde InDesign, sino exportar a PDF/X-4 e imprimir desde Acrobat. Al parecer resulta mas seguro y sencillo.
Utilizando la configuración por defecto, a un controlador PostScript (PS nivel 3) no el PCL, comprobar que la "corrección" de color de la impresora esta en Ninguna.
En Acrobat convertir al imprimir las tintas planas a CMYK, no dejar tampoco que se encargue la impresora de hacerlo.
Se puede imprimir directamente desde InDesign si se prefiere, pero hay que hacer varios ajustes adicionales en el cuadro de impresión.