Hola Federico, hasta donde yo sé Adobe Acrobat comprime SIEMPRE las imágenes, independientemente del formato original, TIFF, PNG, etc … Yo creo que poniendo en las preferencias la máxima calidad de salida esto no supone un problema grave en la mayoría de imágenes "NORMALES". El problema mío es que las imágenes son de manuales de instrucciones, con abundante texto, habitualmente pequeño, y ahí cualquier reducción en la calidad de la imagen si se nota en el resultado final.
Ahora estoy tratando de familiarizarme con INDESIGN, que permite mucho mas control sobre las imágenes.
No puedo adjuntar las imágenes, ya que el sistema del foro no permite la inclusión de PDF.
Muchas gracias por tu interés.