Hola y bienvenido.
Yo creo que no existe "el mejor programa" para casi nada; lo que hay es "el programa que me gusta/acomoda más". Sin saber más detalles, yo te diría que me quedaría con InDesign. Aunque hay personas que no pueden vivir sin que Word intente a cada rato adivinar lo que quieren hacer (en mi caso, con fracasos rotundos y muy molestos para mí). Pero hay varios más, no necesariamente de Adobe.
Y hay una consideración sumamente importante: cuál será el destino final de tu maquetación. Por ejemplo, hay muchos impresores (de los que usan prensas, no impresoras) que no quieren ver nada en Word ni en pintura...